藥物治療脂肪肝改善與心血管疾病，血脂與血糖代謝紊亂有密切關係。 單純性脂肪肝病經過飲食運動等基礎治療半年後無明顯好轉，在醫生指導下選擇減肥丸或二甲雙胍輔助減肥。轉氨酶升高的患者可以選擇多烯磷脂醯膽鹼、維生素E等藥物來預防肝臟炎症和纖維化，降低肝硬化的發生概率。

 高脂血症的脂肪肝改善患者應根據高脂血症的類型和程度以及發生動脈硬化性心腦血管疾病的概率決定是否使用降脂藥物。 運動充足可以有效減少多餘脂肪，改善胰島素抵抗，減少肝內脂肪沉積。 建議患者選擇中等強度有氧運動，包括跑步，騎自行車，游泳，健美操，舞蹈等。 運動強度不宜過小，堅持每週適度強度有氧運動時間150分鐘。 儘量做到“能坐或不躺，能站或不坐，能走或不站，能快或慢”。